Счетная палата выявила системные проблемы в содержании объектов культурного наследия, принадлежащих СПбГУ. По итогам 2025 года зафиксированы нарушения предписаний органов охраны наследия и прокуратуры по 71 объекту университета, при этом по 48 из них проблемы не решаются более 6 лет. Университет заявил о потребности в 82,6 млрд рублей на период 2025–2027 гг. для устранения критических нарушений, однако фактические расходы на сохранение объектов в 2025 году составили лишь 726,5 млн рублей (из них 661,7 млн рублей — из федерального бюджета), при общем объеме федерального финансирования вуза в 16,7 млрд рублей за год. Аудиторы предупредили о рисках начисления штрафов за неисполнение судебных решений и указали на дефицит средств на реставрационные работы.